En el programa Inocuidad Pecuaria, se llevan a cabo acciones que buscan fomentar la Implementación de las Buenas Practicas Pecuarias y los Sistemas de Reducción de Contaminantes en Unidades de producción y procesamiento primario de productos  pecuarios,  con el fin de prevenir la presencia de  posibles contaminantes físicos, químicos y biológicos en la producción primaria.

La asistencia técnica, capacitación, monitoreo de contaminantes y divulgación son las acciones del programa, mediante las cuales se busca  fomentar las Buenas Prácticas Pecuarias en nuestra población objetivo, y con ello obtener productos inocuos que sean confiables para consumo local e importación a mercados internacionales, además de fortalecer el conocimiento de los productores y mantener bajo vigilancia su producción final. 

Es un programa voluntario y gratuito, dirigido a productores pecuarios de la entidad para implementar medidas que reduzcan los riesgos de contaminacion de sus productos, lo cual esta regulado por la Secretaria de Agricultura a través del Servicio Nacional de Sanidad, Inocuidad y Calidad Agroalimentaria (SENASICA).